Sú aj také dni - dni neúspešných reakcií


Sú aj také dni a týždne. Keď sa jednoducho nedarí pripraviť látky, ktoré máme za cieľ syntetizovať. Taký bol môj týždeň 14.-18. január.

Deje sa tam niečo, či nie?


Na začiatku ste doslova nažhavený, sledujete priebeh reakcie, zafarbenie reakčnej zmesi, medzičasom doštudovávate všeobecný charakter prebiehajúcej reakcie (veď, čo ak som predsa len na niečo počas vyhľadávania reakcií zabudol?)a samozrejme TLC-čkujete o sto šesť. Deje sa tam niečo, či nie?

Pracovný kolobeh organického chemika v laborke

Nádejate sa, že ono sa naozaj niečo deje, keď vám ubúdajú vychodzie látky. K tomu zmeny farby reakčnej zmesi a súčasne vidíte tvorbu mini fliačiku na TLC platničke. Reakcii dáte čas ešte cez noc. Ráno vstanete a s entuziazmom, trielite do laborky. A je to tam … východzia látka je kompletne zreagovaná a k tomu na vás majoritne hladí fliačik v sprievode s inými zanedbateľnými (hádam iba) vedľajšími produktami.
Reakčnú zmes spracujete, prevediete všetko do organickej fázy, ktorú zbavíte vody, odparíte a šup so vzorkou na NMR analýzu, nech sa presvedčíme, či sa jedná o nami zamýšľanú látku.

Radosť, či čiastkové sklamanie


Počkáte si na jej výsledok, ktorý vás buď rozradostní a vy pokračujete vo viackrokovej syntéze ďalej alebo ... Sú dni, keď vás výsledok MS, či NMR analýzy sklame na celej čiare. Vidíte, že jeden spot, o ktorom túžobne hovoríte ako o presne tej cieľenej látke je, žiaľ, iba nanič zmeskou x a viac zlúčenín. Vaše NMR spektrum vyzerajú ako taký prales píkov, či džungľa ihlíc v ktorom sa veru nemá zmysel moc hrabať. Poviete si: “A pri tom, to bola taká nádejná reakcia …”


Výzvy pred nami 


Chémia sacharidových zlúčenín, príprava glykomimetík býva z času na čas aj taká. Nevyspytateľná a aj po rokoch plná výziev, plná zvratov v boji o prípravu cieľového produktu. Je to taká sladká detektívka ako sa dostať k produktu veľkej hodnot avšak sú aj dni neúspešných reakcií, tak sa obrňte trpezlivosťou.


Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

Milovaný pondelok

Image
Pondelok je pre mnohých považovaný za deň - strašiak. Po sladkom oddychovom víkende má prísť horor navlečený do rúcha pondelku. Ja sa  ale na pondelok teším! A dôvod je prostý: Som syntetický organický chemik a milujem svoju prácu. Priznám sa, že už v nedeľu večer jedným okom imaginárne pokukávam po novej reakcii, ktorú mám v pláne vyskúšať. Všetko predom napočítané, úskalia syntézy identifikované, rozpúšťadlá, aparatúry vysušené. A ide sa do toho! Svoju prácu syntetického organického chemika mám rád aj preto, že častokrát pripravujem látky, ktoré ešte nik nevyrobil. Originály! Novel compounds! Predstava toho, že pracujem na projekte, ktorý si za cieľ kladie pripraviť práve takéto látky ma ženie vpred. Dáva mi to chuť do ranného vstávania a drží moje nasadenia od pondelka do piatku. Ako za odmenu vychádzajú po vydarených syntézach z chromatografických kolón čisté látky, štruktúrne potvrdené NMR analýzou. Pocit, že syntetizované látky  naozaj plnia svoj účel, v mojom prípa
Read more

Liečivý alkaloid? - môj augustový príspevok do Quarku

Image
Vedcom zo Stanfordovej univerzity sa podarilo izolovať a štruktúrne charakterizovať dosiaľ neznámy alkaloid obsiahnutý v jede mexického škorpióna Megacormus gertschi. Následne nový alkaloid synteticky pripravili a v súčasnosti sa jeho deriváty testujú na antimikrobiálnu aktivitu a zníženie krvného tlaku. Škorpióny sú fascinujúce článkonožce, ktoré vznikli asi pred 430 miliónmi rokov v období silúru. Vo svojich jedových bodcoch produkujú cenný kokteil látok na prípravu často zatiaľ nepreskúmaných bioaktívnych zlúčenín, a aj preto sú teraz v kurze. Skryté prekvapenie Jed škorpiónov je komplexná zmes peptidov, enzýmov, glykoproteínov, jednoduchých aminokyselín, nukleotidov, lipidov či anorganických solí. Vstreknutie tohto chemického kokteilu paralyzuje korisť, a tak poskytuje zadováženie potravy a, samozrejme, aj obranu. Predpokladá sa, že škorpióny sú schopné syntetizovať viac ako 100 000 rôznych polypeptidov, z ktorých sa doteraz podarilo izolovať a biologicky testovať menej
Read more

What would I do?

Image
I was born in Slovakia in 1990. My parents and their families have lived in previous regime. They disliked it very much. They were tremendously excited for freedom coming in democracy package thanks to Velvet revolution. It was not all easy especially during Mečiarizmus era, but we made it to EU and NATO. Thanks godness! I remember them being truly happy about joining European community.  When I was little, My father told me: You know, I used to dream about being born in Switzerland, but I could have also been born in some poor African country or harshly opressing land. That made me think a lot. I have this conversation vividly in my mind, as if it was just days back. How about being born and lived in Ukraine? I disagree with the oppression, that people of Ukraine experience. It is pointless war. Barbarian attack. Sad, very sad. People are dying. Families are torn apart. Fatherless children, hopeless mothers.  As a scientist, father and son, I ask myself - what would I do - in the thei
Read more